Ferdinand Wilhelm von Bayern, ein Prinz aus der bayerischen Linie der Wittelsbacher, war der Sohn des Kurfürsten Ferdinand Maria und der Henriette Adelheid von Savoyen. Als nachgeborener Sohn war seine Laufbahn innerhalb der dynastischen Planungen des bayerischen Kurhauses primär für den kirchlichen Dienst vorgesehen, um den bayerischen Einfluss in den geistlichen Territorien des Reiches zu festigen.

Bereits in jungen Jahren wurde er mit zahlreichen Pfründen ausgestattet und bekleidete Ämter als Domherr in verschiedenen bedeutenden Bistümern, darunter Köln, Münster und Lüttich. Seine Position im Kölner Domkapitel war von besonderer strategischer Relevanz, da das Erzbistum Köln über Generationen hinweg als wittelsbachische Sekundogenitur fest in der Hand des bayerischen Hauses verblieb. Ferdinand Wilhelm fungierte hier als wichtige Stütze der landesherrlichen Politik seines Bruders, des Kurfürsten Max Emanuel.

Über seine geistlichen Verpflichtungen hinaus war er als General-Kommissar der bayerischen Armee tätig und bewies administratives Geschick in der Organisation des Militärwesens. Diese Doppelfunktion als kirchlicher Würdenträger und militärischer Verwalter war bezeichnend für die Verflechtung von dynastischer Macht und kirchlicher Karriere im Barockzeitalter. Sein Wirken trug maßgeblich dazu bei, die Stellung der Wittelsbacher im Nordwesten des Reiches zu stabilisieren. Trotz seiner hohen geistlichen Ämter trat er politisch vor allem als loyaler Vertreter der Interessen seines Hauses in Erscheinung. Sein Leben blieb eng mit der glanzvollen, aber auch kriegerischen Epoche des bayerischen Barock verbunden, in der die Grenzen zwischen geistlicher Autorität und weltlichem Machtanspruch oft fließend waren.